Fu uno dei maggiori intellettuali dei primi secoli cristiani. A lui si deve la prima esposizione organica e sistematica della fede. Importanti i suoi contributi ai Concili di Antiochia e di Costantinopoli. Nel suo pensiero è chiara l'influenza neoplatonica, ma con rielaborazioni originali.
«Nessun altro Padre del secolo IV fece un così largo uso della filosofia come Gregorio Nisseno, nei suoi sforzi per accostare i misteri della fede all'intelligenza umana. Egli paragona la filosofia alla Sposa del Cantico dei Cantici, perché ci insegna quale atteggiamento adotta...